Inloggen
Laatste nieuws
Wetenschap

Hoe voorspelbaar is virale evolutie?

Plaats een reactie

Een model dat wetenschappers in staat stelt het verschijnen van potentiële nieuwe mutaties in opkomende en toekomstige varianten SARS-CoV-2 te voorspellen – wie wil dat niet? M. Cyrus Maher e.a. presenteren zo’n model in Science Translational Medicine – met enig voorbehoud, dat wel.

Zij ‘trainden’ hun model met data uit eerdere golven van de pandemie. Het functioneerde goed: het bleek in staat om de verspreiding van spike-eiwitmutaties goed te voorspellen over verschillende fasen van de pandemie, tot wel vier maanden van tevoren. Ze valideren hun bevindingen bovendien tegen hetgeen we weten over de omikronvariant.

Niet dat het voorspellen van virale evolutie nu een fluitje van een cent is, ook al draait het model op een gewone laptop. Wat Maher e.a. feitelijk doen is voorspellen welke mutaties in de nabije toekomst in frequentie zullen toenemen boven een bepaalde drempel, en dat op basis van de analyse van recente verspreidingspatronen, genomische surveillancegegevens en aminozuurkenmerken. De studie voorspelt dus niet de opkomst van voorheen nooit waargenomen mutaties.

Aminozuursubstituties, -inserties of -deleties in het spike-eiwit hebben inmiddels geleid tot ruim 160 duizend unieke spike-eiwitsequenties (dat is de stand per december 2021). Een kleine subset van deze mutaties zijn ‘variants being monitored’ (VBM’s), ‘variants of interest’ (VOI’s) of ‘variants of concern’ (VOC’s), zoals geclassificeerd door de Amerikaanse Centers for Disease Control. Maher e.a. wijzen er met nadruk op dat de rol van mutaties in het proteoom buiten het spike-eiwit bij het aansturen van de pandemie nog steeds onvoldoende belicht is.

Lees ook

Nieuws Wetenschap covid-19
  • Henk Maassen

    Henk Maassen (1958) is journalist bij Medisch Contact, met speciale belangstelling voor psychiatrie en neurowetenschappen, sociale geneeskunde en economie van de gezondheidszorg.  

Op dit artikel reageren inloggen
Reacties
  • Er zijn nog geen reacties
 

Cookies op Medisch Contact

Medisch Contact vraagt u om cookies te accepteren voor optimale werking van de site, kwaliteitsverbetering door geanonimiseerde analyse van het gebruik van de site en het tonen van relevante advertenties, video’s en andere multimediale inhoud. Meer informatie vindt u in onze privacy- en cookieverklaring.